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Le programme National de Lutte contre le Paludisme (PNLP) crée depuis 1982 est la structure nationale chargée de la conception, de la planification, de l'organisation et du suivi-évaluation des activités de lutte contre le paludisme au Benin. Dans ce sens plusieurs plans de lutte contre le paludisme ont déjà été mis en œuvre.
Au cours de ces dernières années, le développement d'une résistance accrue du parasite aux principaux antipaludiques, et l'avènement de nouvelles technologies de lutte ont amene le Benin a adopter une nouvelle politique de lutte contre le paludisme axée sur trois principales interventions :

• L'utilisation des combinaisons thérapeutiques a base d'artemisinine pour le traitement des cas de paludisme simple ;
• La lutte anti vectorielle intégrée basée sur l'utilisation des Moustiquaires Imprégnées de Longue Durée d'action, la pulvérisation intra domiciliaire, l'utilisation de larvicides ;
• Le traitement préventif intermittent chez les femmes enceintes.